Normal kan pıhtılaşması (koagülasyon), pıhtılaşma etmeni olarak bilinen 20 farklı plazma proteinini içeren karmaşık bir işlemdir. Bu etmenler, kanamayı durduran bir protein olan fibrinin üretimine yol açan bir tepkimeyi oluşturmak için birbirlerini etkilerler. Kanama bozukluklarında, belirli pıhtılaşma etmenleri kusurlu veya eksiktir. Bu tür bir bozukluk hemofilide olduğu gibi kalıtımsal olabilir. Olağandışı kanama ayrıca K vitamini eksikliği, şiddetli karaciğer hastalığı veya pıhtılaşmayı önleyici ilaçlarla uzun süreli tedavilerden kaynaklanabilir.
Kan damarmdaki pıhtı, trombüs olarak adlandırılır. Trombüsler, hasarlı kan damarı duvarlarında oluşabilir; bu nedenle damar sertliği olan hastalarda görülme olasılığı daha fazladır. Normalden daha yavaş kan akışı da pıhtılaşmaya neden olabilir; örneğin varisli damarlarda ve uzun süreli yatak istirahati gereken insanlarda görülür. Sigara içmek ve
bazı doğum kontrol hapları da kan pıhtılaşmasına neden olabilir.
Trombüs bir atardamarı tıkayabilir ve aşağı yöndeki dokuların oksijen yetersizliğinden ölmesine neden olabilir; ayrıca bir toplardamarı da tıkayabilir. Eğer beyne giden bir atardamarda oluşursa, inmeye neden olabilir. Kan pıhtısı yerinden oynayabilir ve yukarı yönde hareket ederek yerleştiği yerde iskemiye (kan akınımın azalması) neden olabilir. Böyle durumlar da emboli (kan dolaşımında yabancı madde olması) olarak adlandırılır. -Trombüs bacak veya leğen boşluğundaki toplardamarda oluşup, daha sonra koparak akciğere yerleşebilir.