Çeşitli konjenital hastalıklar karaciğeri etkileyebilir. Bunlar arasında safra kanallarının gelişmediği safra kanalı atrezisi ve safra metabolizmasından sorumlu enzimlerle ilgili problemler vardır. Bu hastalıklara yakalanan çocuklarda doğumdan sonraki ilk birkaç gün veya haftada sarılık görülür. Bu bütün bebeklerde doğumdan kısa süre sonra bir şekilde olan ve birkaç günde kaybolan hafif sarılıktan ayırt edilmelidir.